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客户文章非霍奇金淋巴瘤NHL中慢 [复制链接]

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上海元莘生物合作客户在《InternationalJournalofCancer》(IF7.4)发表了一篇题目为“CharacterizationofhepatitisBvirusinfectionandviralDNAintegrationinnon-Hodgkinlymphoma”的文章,对HBV感染与NHL的关系及其可能的机制进行了探究。

研究背景

越来越多的血清流行病学证据表明,慢性乙型肝炎病毒(HBV)感染与非霍奇金淋巴瘤(NHL)之间存在显著的相关性。然而,HBV是否会感染NHL细胞仍存在争议。为了探讨HBV感染与NHL的关系及其可能的机制,本研究不仅从血清流行病学角度进行了综合研究,还从分子遗传学的角度对HBV感染与NHL的关系进行了研究。

研究方法

材料:NHL患者、健康人

方法:HIVID检测、捕获测序、ELISA、免疫组织化学

研究结果

研究人员对93例DLBCL和5例淋巴结组织进行了HBsAg和HBcAg免疫组织化学染色(图1)。结果显示,HBsAg一般位于细胞膜和细胞质,HBcAg主要存在于胞浆和胞核。另外,在对NHL中HBVDNA整合进行鉴定,发现整合后的HBV可以被认为是侧翼基因的一个强有力的顺式作用元件,可影响靶基因的表达。

研究人员对小于bp的断裂点的注释基因进行分析,发现有7个蛋白编码基因(ANKS1B,CAPZB,CTNNA3,EGFLAM,FHOD3,HDAC4andOPCML)是HBVDNA的重复靶点,6个非编码RNA基因(LINC、LINC、LINC、LINC、MIR、PWRN1)也是HBVDNA的重复靶点。值得注意的是,在基因间隔区,HBV的共同整合位点很少(图2)。

对NHL中个HBV靶基因进行GO注释,结果表明,与发育过程和细胞分化、信号转导、细胞连接和转录调控相关的较为显著(图3A)。在KEGG通路分析中,轴突引导是最重要的通路,其次是RAS信号、糖胺多糖生物合成和细胞因子-细胞因子受体相互作用(图3B)。另外,在对肝细胞癌中HBV靶基因的KEGG分析还显示轴突引导和RAS信号是10个途径中显著富集中最显著的两个(图3C),这意味着在这两种恶性肿瘤中,一些途径通常受到HBV整合的影响。

利用TCGA和GTEx的数据分析了这些基因的mRNA表达。在47例NHL组织中,ANKS1B、EGFLAM、ZBTB38、CCDC91、XKR6和MAN1C1等6个基因和HDAC4基因分别显著上调和下调(图4D-J)。同时,研究人员还发现ZBTB38高表达的NHL患者比ZBTB38低表达的NHL患者预后更差(图4K)。此外,CCDC91高表达的患者总生存期较短,具有临界意义(图4L)。

研究结论

研究人员利用血清学、组织学和遗传学的方法证明了HBV感染和NHL密切相关,HBV靶基因的表达分析确定了7个新的候选基因,它们可能在NHL的发生发展中具有潜在的功能。综上所述,这些结果为HBV感染是NHL的病因提供了直接证据,HBV整合断裂点的信息为研究HBV诱导的NHL的发病机制提供了新的线索。

文献链接:

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