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IF38585CancerCell研 [复制链接]

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早筛网讯:近日,一篇发表在《癌症细胞》上的大型跨国研究论文表示,血小板RNA可以帮助检测18种肿瘤类型,并定位某些肿瘤的起源部位。

这项涵盖了数千个样本的大型跨国研究由荷兰阿姆斯特丹大学医学中心的研究人员主导,神经科学家MyronBest是该论文的通讯作者,他表示:“这项研究起始于几年前的一个观察发现,即血小板可以封存来自肿瘤的RNA。”

血小板在外周血中含量很高,尽管没有细胞核,但含有来自巨核细胞的前mRNA转录物,其在受到刺激后可以拼接成成熟的mRNA。年,Best和他的合作者共同发表了一项研究,表示肿瘤可以通过改变血小板的RNA谱来诱导血小板,而被肿瘤诱导的血小板(TEP)RNA特征可以用来作为局部和转移性癌症的辅助诊断方法。

“血小板具有高反应性,在癌症存在时,这些血小板发生了从‘好’到‘坏’的角色转变。”据Best介绍,血小板不仅能从肿瘤中封存RNA,还在癌症的进展和转移中发挥了作用。此外,TEP衍生的RNA谱可能具有肿瘤特异性,类似于提供指纹的身份认证,可用于识别不同的癌症类型。

在此基础上,年Best的团队发表了另一篇研究,描述了血栓测序(ThromboSeq,一个基于多重TEPRNA的工作流程,可以将优化的实验方案与机器学习协同起来,用于癌症检测)可以帮助识别早期和晚期的非小细胞肺癌。

在最新的研究中,研究人员分析了从欧洲到北美的十几个生物医学机构收集的多人的血小板样本(经过质控最终纳入样本数为个),这些样本涵盖了18到92岁的男女,代表了18种不同的肿瘤类型(按有无症状分组对照研究)。

样本供应机构亚组分析

Best表示,该研究旨在回答三个主要问题,即

是否可以利用TEPRNA来开发一种在早期阶段拥有高度特异性的癌症测试?是否有可能利用TEPRNA信号来确定肿瘤的起源部位?以及发生了转移的癌症是否对血小板RNA谱有额外的影响?

“除了这些,还系统性地研究了以前开发的ThromboSeq是否在技术上和生物学上对癌症的检测都很有力。”该研究的第一作者、阿姆斯特丹大学医学院的研究员SjorsintVeld补充道。

研究结果显示,ThromboSeq在无症状对照组中达到了99%的特异性。在个I期到IV期癌症患者的血液样本中,该测试正确识别了三分之二癌症的存在。具体来说,该测试正确检测了46%的I期肿瘤,47%的II期肿瘤,54%的III期肿瘤,72%的IV期肿瘤,以及61%的未知期肿瘤。

在有症状的对照组中包括了患有炎症、心血管疾病和良性肿瘤患者的血液样本,该检测的平均特异性下降到了78%。假阳性的增加表明,病人的潜在疾病或状况可能会妨碍ThromboSeq的检测准确性。

使用TEPRNA检测早期与晚期肿瘤

此外,该研究还显示,ThromboSeq正确地定位了80%以上的癌症患者(共五种肿瘤类型)的肿瘤起源部位。研究人员还发现,至少对于脑癌来说,原发和转移的肿瘤部位都会影响血小板RNA谱。

脑转移定位测试TEPs

出乎意料的是,最初被研究人员排除在ThromboSeq机器学习算法训练过程之外的两种肿瘤类型——淋巴瘤和食道癌,也被算法很好地识别为癌症,这表明了血小板RNA的泛癌种特征。

福克斯-切斯癌症中心的泌尿科肿瘤学家LauraBukavina认为,尽管血小板RNA有潜在的诊断作用,但与直接来自癌细胞的循环肿瘤DNA(ctDNA)相比,血小板RNA更像是一种疾病状态的预测性生物标志物,而不是肿瘤中特定突变的指标。“ctDNA对于特定疾病的预测要比血小板RNA更敏感,后者会受到许多疾病过程的干扰。”Bukavina指出,

血小板RNA被用来作为筛查高风险人群的工具也许更加合适

Best表示目前基于ThromboSeq的癌症检测确实有局限性,包括需要提高特异性和准确性,特别是对于有其他潜在疾病的患者。此外,他和intVeld认为该研究还需要对血小板RNA和其他生物标志物(如ctDNA)进行正面的比较。他们希望在一项具有更大样本量的前瞻性研究中继续验证TromboSeq的诊断效用,包括更多的健康对照。从长远来看,Best认为血小板RNA不会取代其他生物标志物,而是会成为一种重要的分析物,可以

作为其他类型液体活检的

补充。

从应用上讲,Best表示,ThromboSeq的潜在用途之一是作为一种对普通人还有某些癌症易感性人群的筛查测试。此外,血小板RNA有可能帮助临床医生为某些肿瘤类型制定适当的治疗计划,例如,当胶质母细胞瘤患者接受脑部化疗和放疗时,组织在影像学上可能会出现假性进展,而研究表明ThromboSeq很可能反映胶质母细胞瘤的真实肿瘤行为,它或许可以作为一个补充诊断工具帮助临床医生辨别真正的癌症进展和假性进展,以制定更好的治疗计划。

就ThromboSeq的成本而言,Best表示,在学术上,粗略估计每个样本的测试材料成本约为欧元(约96美元),整个检测流程通常可以在两周内完成。

参考资料:

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