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欧易生物精彩派送2021单细胞项目文章汇 [复制链接]

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回顾年,是欧易生物单细胞事业部硕果累累的一年,助力合作客户发表33篇单细胞文章,平均IF达8.。今天,小编带着大家一起回顾欧易单细胞的吧~

NO.1

基于成像质谱技术的肝癌微环境拓扑分析揭示了不同个体发育的巨噬细胞对细胞邻域的反向调节

Topologicalanalysisofhepatocellularcarcinomatumourmicroenvironmentbasedonimagingmasscytometryrevealscellularneighbourhoodregulatedreverselybymacrophageswithdifferentontogeny

发表期刊:Gut

影响因子:23.

DOI:10./gutjnl--

文章概述:肝细胞癌(HCC)肿瘤微环境(TME)是高度复杂的,具有组织成各种功能单元、细胞邻域(CN)的多种细胞成分。该研究结果首次揭示了肝细胞癌肿瘤微环境的各种拓扑功能单元,也提供了最大的肝细胞癌病理景观库。这项工作突出了特异性靶向Kupffer细胞而不是阻断髓样细胞整体作为肝细胞癌治疗的新型免疫疗法的潜力。

NO.2

Kdm6b调节肠道上皮内TCRαβCD8αα淋巴细胞成熟和细胞毒性的机制

ThehistonedemethylaseKdm6bregulatesthematurationandcytotoxicityofTCRαβCD8ααintestinalintraepitheliallymphocytes

发表期刊:CellDeathandDifferentiation

影响因子:15.

DOI:10./s---w

文章概述:该研究主要证明了Kdm6b能够以细胞内作用方式调控小肠IELs的发育和功能。作者首先构建了T细胞中条件性敲除Kdm6b的小鼠模型(Kdm6bF/F-CD4Cre),通过单细胞转录组和V(D)J测序发现Kdm6b的缺失导致IELs中TCRαβ细胞的比例减少,TCR多样性降低以及TCRV-J基因重排的差异,发现Kdm6b在维持在小肠IELs稳态中的关键作用。随后通过流式证实Kdm6b的缺失会破坏IELs胸腺前体细胞IELPs的稳态和迁移,促进TCRαβCD8ααIELs凋亡,从而导致肠道中TCRαβCD8αα数量减少。通过bulkRNA-Seq、ChIP-qPCR和CUTTag-seq等表明Kdm6b能够通过清除相关基因增强子和启动子区域的抑制性H3K27Me3修饰来促进TCRαβCD8ααIELs抗凋亡基因Bcl2及细胞毒性基因Gzmb和Fasl的表达,从而促进TCRαβCD8ααIELs的成熟,Kdm6b也能够通过降低启动子上的H3K27Me3水平调控肠道归巢分子CCR9的表达。

NO.3

通过小鼠反应性胶质化消除中风亚型依赖性突触

Strokesubtype-dependentsynapseeliminationbyreactivegliosisinmice

发表期刊:NatureCommunications

影响因子:14.

DOI:10./s---x

文章概述:卒中(stroke)在全世界范围内都是一种高致死高致残的疾病,严重危害了人类的生命健康。本研究主要探索小胶质细胞/巨噬细胞(microglia/macrophage)和星形胶质细胞(astrocyte)在缺血性卒中和出血性卒中修复阶段的突触吞噬情况。利用缺血性脑卒中(MCAO)和出血性脑卒中(ICH)小鼠模型,作者发现两种胶质细胞在缺血性脑卒中(ischemicstroke)模型小鼠中介导突触吞噬,导致突触丢失影响了疾病预后;而在出血性脑卒中(hemorrhagicstroke)模型小鼠中只有小胶质细胞/巨噬细胞介导突触吞噬,星形胶质细胞无明显作用。

NO.4

单细胞RNA+单细胞ATAC测序助力解析小鼠不同器官γδT细胞异质性图谱

Single-cellRNA-seqandchromatinaccessibilityprofilingdeciphertheheterogeneityofmouseγδTcells

发表期刊:ScienceBulletin

影响因子:11.78

文章概述:γδT细胞具有重要的免疫监视功能,其不同亚型在维持组织稳态和局部免疫反应中发挥不同作用,但是γδT细胞的异质性尚未完全解析。本文作者对小鼠胸腺、脾脏和淋巴结中的γδT细胞开展了单细胞转录和染色质开放性组学分析,系统性解析了其异质性。本文构建了小鼠γδT单细胞转录图谱和单细胞染色质开放性图谱,为深入解析γδT细胞异质性和亚群调控机制提供了宝贵的资源库。

NO.5

急性肺损伤过程中间充质干细胞介导的募集单核吞噬细胞的免疫调节:高维分析研究

Mesenchymalstemcell-mediatedimmunomodulationofrecruitedmononuclearphagocytesduringacutelunginjury:ahigh-dimensionalanalysisstudy

发表期刊:Theranostics

影响因子:11.

DOI:10./thno.

文章概述:急性肺损伤(ALI)招募单核吞噬细胞在肺损伤和修复中起关键作用。本研究在脂多糖(LPS)诱导的ALI小鼠模型中研究了募集单核吞噬细胞的类型和异体间充质干细胞(MSCs)的免疫治疗作用。

NO.6

内源性p27和Ki67的可视化揭示了c-Myc驱动的代谢开关在促进静止癌细胞存活中的重要性

Visualizationofendogenousp27andKi67revealstheimportanceofac-Myc-drivenmetabolicswitchinpromotingsurvivalofquiescentcancercells

发表期刊:Theranostics

影响因子:11.

DOI:10./thno.

NO.7

早期和晚期肺腺癌中单个肿瘤和免疫细胞图谱和动态变化

Landscapeanddynamicsofsingletumorandimmunecellsinearlyandadvanced-stagelungadenocarcinoma

发表期刊:Clin.Transl.Med

影响因子:11.

DOI:10./ctm2.

NO.8

单细胞图谱解析人间充质干细胞异质性

Single-celltranscriptomeatlasofhumanmesenchymalstemcellsexploringcellularheterogeneity

发表期刊:ClinicalandTranslationalMedicine

影响因子:11.

DOI:10./ctm2.

文章概述:作者从11个健康供体的样本中获得约,个细胞,构建了不同组织的MSCs单细胞图谱。对MSCs进一步分析研究,发现组织特异性以及具有保守性的MSCs亚群,ECM在MSCs异质性中起到决定作用。此外,ECM相关的炎症、衰老、抗原处理和呈递等功能在组织特异性亚群中也是高度异质性的。拟时序分析进一步说明MSCs组织内以及不同组织间的异质性。发育轨迹的构建也说明了MSCs组织间和组织内的异质性。

NO.9

单细胞转录组显示高级别浆液性卵巢癌的异质性

Single-celltranscriptomesrevealheterogeneityofhigh-gradeserousovariancarcinoma

发表期刊:ClinicalandTranslationalMedicine

影响因子:11.

文章概述:高级别浆液性卵巢癌(HGSOC)是最常见的上皮性卵巢癌,对该疾病的异质性和分子基础仍然不完全了解。作者鉴定出一种具有高增殖和耐药性潜力的上皮细胞亚群,进一步实验证实了它们在卵巢癌细胞生长和迁移中的作用。通过拟时序分析,发现包括翻译机制在内的多种信号通路的失调与卵巢癌转移有关。此外,SCENIC分析揭示了基因调控网络的相互作用,并通过JUN/AP-1抑制剂T-验证,表明JUN可作为潜在的卵巢癌治疗靶点。

NO.10

心脏免疫细胞的单细胞转录组分析揭示Rel驱动的CD72阳性巨噬细胞诱导心肌细胞损伤

Single-celltranscriptomicanalysesofcardiacimmunecellsrevealthatRel-drivenCD72-positivemacrophagesinducecardiomyocyteinjury

发表期刊:CardiovascRes

影响因子:10.

DOI:10./cvr/cvab

NO.11

单细胞测序揭示2型糖尿病小鼠视网膜细胞的新转录图谱和异质性

Pathogenesisstudybasedonhighthroughputsingle-cellsequencinganalysisrevealsnoveltranscriptionallandscapeandheterogeneityofretinalcellsintype2diabeticmice

发表期刊:Diabetes

影响因子:9.

DOI:10./db20-

NO.12

促炎性和增殖性小胶质细胞驱动胶质母细胞瘤的进展

Pro-inflammatoryandproliferativemicrogliadriveprogressionofglioblastoma

发表期刊:CellReports

影响因子:9.

DOI:10./j.celrep..

NO.13

单细胞测序助力解析气道gobletcell化新机制

LKB1dificiencyupregulatesRELM-αtodriveairwaygobletcellmetaplasia

发表期刊:CellMolLifeSci

影响因子:9.

DOI:10./s18---w

NO.14

5mC调控子分子亚型系统,描绘膀胱癌微环境特征并指导精准医疗

5mCregulator-mediatedmolecularsubtypesdepictthehallmarksofthetumormicroenvironmentandguideprecisionmedicineinbladdercancer

发表期刊:BMCMedicinee

影响因子:8.

DOI:10./s--63-6

NO.15

单细胞RNA测序揭示阿尔茨海默病的B细胞相关分子生物标记物

Single-cellRNAsequencingrevealsBcell–relatedmolecularbiomarkersforAlzheimer’sdisease

发表期刊:ExpMolMed

影响因子:8.

DOI:10./s---8

NO.16

单细胞测序助力解析食管鳞状细胞癌分子图谱特征

Dissectingthesingle-celltranscriptomenetworkunderlyingesophagusnon-malignanttissuesandesophagealsquamouscellcarcinoma

发表期刊:EbioMedicine

影响因子:8.

DOI:10./j.ebiom..

NO.17

单细胞测序助力解析新辅助化疗手段——紫杉醇+顺铂与单纯手术治疗在食管鳞状细胞癌中的肿瘤微环境差异

Dissectingthesingle-celltranscriptomenetworkinpatientswithesophagealsquamouscellcarcinomareceivingoperativepaclitaxelplusplatinumchemotherapy

发表期刊:Oncogenesis

影响因子:7.48

DOI:10./s---2

NO.18

子宫腺肌症在位内膜和异位病变的单细胞转录组学分析

Single-celltranscriptomicanalysisofeutopicendometriumandectopiclesionsofadenomyosis

发表期刊:CellBiosci

影响因子:7.

DOI:10./s---z

NO.19

单细胞转录组测序解析子宫内膜异位症成纤维细胞命运与免疫细胞异质性

Single-celltranscriptomicanalysisofendometriosisprovidesinsightsintofibroblastfatesandimmunecellheterogeneity

发表期刊:CellBiosci

影响因子:7.

DOI:10./s---x

NO.20

从鼻腔到法氏囊,IBDV感染鸡法氏囊的单细胞测序机制研究

Fromnasaltobasal:single-cellsequencingofthebursaofFabriciushighlightstheIBDVinfectionmechanisminchickens

发表期刊:CellBiosci

影响因子:7.

DOI:10./s---9

NO.21

单细胞助力解析小鼠膀胱尿路上皮细胞图谱和分化特征

Single-celltranscriptomesofmousebladderurotheliumuncovernovelcelltypemarkersandurothelialdifferentiationcharacteristics

发表期刊:CellProlif

影响因子:6.

DOI:10./cpr.07

NO.22

复发性难治性多发性骨髓瘤的病例研究通过将连续基因组学与单细胞转录组相结合,揭示了浆细胞的克隆进化和基因调控网络

Acasestudyofrelapsedandrefractorymultiplemyelomarevealsclonalevolutionandgeneregulatorynetworksofplasmacellsvia

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