嫩肤论坛

注册

 

发新话题 回复该主题

中外合作揭示急性B淋巴细胞白血病分子分型 [复制链接]

1#
北京治疗白癜风哪家安全 http://wapyyk.39.net/hospital/89ac7_detail.html

责编丨迦溆

白血病(Leukemia)也称为“血癌”,是一类起源于造血干细胞的恶性肿瘤。从基因层面上来说,白血病的发生发展与基因的改变密切相关。在正常生理过程中,每个人的DNA复制都受到非常精密的调控,严格遵守中心法则,并且还有多种辅助机制对复制中产生的突变进行检查和修复。但在肿瘤形成过程中,细胞的基因组复制常会引入一定的变异,比如单碱基突变,融合基因等。这些染色体结构变异或者基因突变不仅是白血病分型的重要依据,还是影响白血病治疗和预后的重要因素。

近日,由上海交通大医院,医学基因组学国家重点实验室,上海血液学研究所,国家转化医学中心(上海)牵头,联合上海儿童医学中心、医院、瑞典隆德大学、日本东京大学、新加坡国立大学等10余家国医院,采用转录组学大数据驱动策略,开展急性淋巴白血病的国际多中心转录组学数据分析,报道了1,例B-ALL病例的转录组全景图谱(图1),如融合基因、基因突变和异常基因表达通路(图2)。该工作近日以TranscriptionallandscapeofBcellprecursoracutelymphoblasticleukemiabasedonaninternationalstudyof1,cases为题发表在PNAS杂志上。

该研究共定义了十四个B-ALL基因表达亚组(G1-G14)。其中八个亚组(G1-G8)与之前的文献报道完全一致(MEF2D基因融合亚组,TCF3-PBX1基因融合亚组,ETV6-RUNX1基因融合/ETV6-RUNX1-like亚组,DUX4基因融合亚组,ZNF基因融合亚组,BCR-ABL1融合/Ph-like亚组,高二倍体核型亚组,和KMT2A融合亚组),同时新定义了六个额外的基因表达亚组:G9与PAX5和CRLF2基因融合相关;G10和G11分别普遍存在PAX5(p.P80R)和IKZF1(p.NY)基因突变;G12与IGH-CEBPE基因融合和ZEB2(p.HR)基因突变;G13和G14分别富集TCF3/4-HLF和NUTM1融合。

预后分析结果显示,在儿童B-ALL中,G2-G5以及G7(51至65/67染色体)亚组较为低危险度,G7(≤50个染色体)和G9为中危险度,而G1,G6和G8为高危险度亚组。在成人B-ALL中,G1,G2,G6和G8与高危险度相关,而G4,G5和G7的相对较好。该项研究所纳入的数据集全面地揭示了B-ALL的基因表达亚组,这些基因表达亚组具有非常明显的基因融合、基因突变和异常基因/通路表达等分子异常特征。同时,该项研究成果为B-ALL疾病分型、预后分层的优化,以及疾病的精准医疗提供重要支持,同时,也强烈建议引入RNA测序作为ALL的常规临床诊断手段之一。

据悉,医院黄金艳研究员、陈赛娟研究员、瑞典隆德大学ThoasFioretos教授、医院Ching-HonPui教授为共同通讯作者,上海交大硕士研究生李剑峰、博士研究生代雨婷和瑞典隆德大学副研究员HenrikLilljebj?rn为共同第一作者。该工作获得了上海交通大学高性能计算中心的大力支持,所有计算均在上海交大的π超算上完成。

原文链接:

分享 转发
TOP
发新话题 回复该主题